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génomique
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génomique
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cours / présentation
4.5. Un alignement de séquences vu comme un chemin dans une grille
Auteur(s)
:
RECHENMANN Francois, PARMENTELAT Thierry
Description
:
Pour comparer deux séquences entre elles, il faut donc les aligner. Aligner ces deux séquences suppose faire des hypothèses d'insertion, délétion, aux bons endroits. Ça signifie, d'un point de vue séquence de caractères, insérer des caractères "blank", le tiret, aux endroits appropriés. Approprié ...
génomique
algorithmique
bioinformatique
biologie cellulaire et moléculaire
modélisation
cours / présentation
1.4. What is an algorithm?
Auteur(s)
:
RECHENMANN Francois
Description
:
We have seen that a genomic textcan be indeed a very long sequence of characters. And to interpret this sequence of characters, we will need to use computers. Using computers means writing program. Writing program means designing first algorithm. So, let's see what an algorithm is. An algorithm ...
DNA
Genome
algorithm
cell
bioinformatics
cours / présentation
2.9. Whole genome sequencing
Auteur(s)
:
RECHENMANN Francois
Description
:
Sequencing is anexponential technology. The progresses in this technologyallow now to a sequence whole genome, complete genome. What does it mean? Well let'stake two examples: some twenty years ago, to sequence the bacillus subtilis bacteria genome took something like ten years,thirty five labor ...
DNA
Genome
algorithm
cell
bioinformatics
cours / présentation
4.2. Why gene/protein sequences may be similar?
Auteur(s)
:
RECHENMANN Francois
Description
:
Before measuring the similaritybetween the sequences, it's interesting to answer the question: why gene or protein sequences may be similar? It is indeed veryinteresting because the answer is related to the theory ofevolution which is due, as you all know, to Darwin. What Darwinsays is that species ...
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algorithm
cell
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