591 ressources en auto-formation : algorithme

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591 résultats
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Résultats de 551 à 560
Présentation de la ressource en auto-formation 3.4. Predicting all the genes in a sequence cours / présentation
3.4. Predicting all the genes in a sequence
Auteur(s) : RECHENMANN Francois
Description : We have written an algorithm whichis able to locate potential genes on a sequence but only on one phase because we are looking triplets after triplets. Now remember that the genes maybe located on different phases and on the two strands. It means that to retrieve all the genes on a genome we have ...
Présentation de la ressource en auto-formation 1.9. Predicting the origin of DNA replication? cours / présentation
1.9. Predicting the origin of DNA replication?
Auteur(s) : RECHENMANN Francois
Description : We have seen a nice algorithm to draw, let's say, a DNA sequence. We will see that first, we have to correct a little bit this algorithm. And then we will see how such as imple algorithm can provide biological results. Again, this is the aim of bioinformatics: analysing the genomic texts and providing ...
Présentation de la ressource en auto-formation 3.4. Prédiction de tous les gènes d’une séquence cours / présentation
3.4. Prédiction de tous les gènes d’une séquence
Auteur(s) : RECHENMANN Francois, PARMENTELAT Thierry
Description : En combinant de façon adéquate la recherche des triplés Stop et Start sur un brin d'ADN, nous avons obtenu un algorithme qui prédit les gènes sur ce brin, mais également sur une phase. C'est-à-dire en groupant les lettres en triplés d'une certaine manière. Nous avons vu qu'il existait 3 phases sur ...
Présentation de la ressource en auto-formation 1.9. Prédire l’origine de réplication cours / présentation
1.9. Prédire l’origine de réplication
Auteur(s) : RECHENMANN Francois, PARMENTELAT Thierry
Description : Nous avons écrit un algorithme sympathique en ce qu'il dessine un chemin conforme à la succession des lettres d'une séquence génomique. Cet algorithme simple, au-delà du dessin qu'il produit, est-il susceptible de produire des résultats interprétables par un biologiste ? La réponse est oui. Nous ...
Présentation de la ressource en auto-formation Premiers principes des langages de programmation cours / présentation
Premiers principes des langages de programmation
Auteur(s) : DOWEK Gilles
Description : Dans cette vidéo, Gilles Dowek fait un cours introductif, à destination des Professeurs des Lycées, de la Science Informatique (et de ses quatre piliers: Algorithme, Langage, Machine, Information) complété d'une analyse fine de la sémantique des ingrédients des algorithmes (instruction, affectation ...
Présentation de la ressource en auto-formation 3.8. Probabilistic methods cours / présentation
3.8. Probabilistic methods
Auteur(s) : RECHENMANN Francois
Description : Up to now, to predict our gene,we only rely on the process of searching certain strings or patterns. In order to further improve our gene predictor, the idea is to use, to rely onprobabilistic methods. What does it mean? I will firsttake an example, which is not related to genomic but I think it'sgood ...
Présentation de la ressource en auto-formation 1.7. Promenade sur l’ADN cours / présentation
1.7. Promenade sur l’ADN
Auteur(s) : RECHENMANN Francois, PARMENTELAT Thierry
Description : Quand les biologistes se sont trouvés confrontés au premier texte génomique, dans la deuxième moitié des années 70, ils ont été quelque peu désemparés. On peut le comprendre. Encore une fois, regardez une petite portion d'un texte de génome bactérien ici. Suite de lettres - C, G, et cetera. - pas ...
Présentation de la ressource en auto-formation 1.4. Qu’est-ce qu’un algorithme ? cours / présentation
1.4. Qu’est-ce qu’un algorithme ?
Auteur(s) : RECHENMANN Francois, PARMENTELAT Thierry
Description : Les génomes peuvent donc être vus comme une longue suite de lettres écrites dans l'alphabet : A, C, G et T. Comment interpréter ces textes ? Ça va être le sujet de la bio-informatique à l'aide d'algorithmes appropriés. Qu'entend-on par algorithme ? Un algorithme peut être vu comme une suite d' ...
Présentation de la ressource en auto-formation 5.5. Quand les différences sont trompeuses cours / présentation
5.5. Quand les différences sont trompeuses
Auteur(s) : RECHENMANN Francois, PARMENTELAT Thierry
Description : Il y a plusieurs raisons pour lesquelles la méthode UPGMA, que nous venons de voir, se révèle simpliste. L'une des raisons par exemple, c'est pourquoi quand on recalcule les distances, quand on a groupé deux espèces et construit un nouveau noeud, pourquoi recalcule-t-on les distances sur la base ...
Présentation de la ressource en auto-formation 4.3. Quantifier la similarité de deux séquences cours / présentation
4.3. Quantifier la similarité de deux séquences
Auteur(s) : RECHENMANN Francois, PARMENTELAT Thierry
Description : Le principe est donc de rechercher, dans les bases de données, des séquences similaires à celles que nous sommes en train d'étudier. Nous faisons aussi l'hypothèse que plus les séquences sont similaires, meilleure est la pertinence de l'information attachée à la séquence retrouvée dans la base de ...