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énoncé de problème
15/07/2002
Ancêtre commun et cladogramme
Auteur(s)
:
Langlois Cyril, Lecointre Guillaume
Description
:
Problème de la représentation dans un cladogramme : position des ancêtres communs et des innovations évolutives, proximité entre espèces (groupes).
ancêtre commun
cladogramme
arbre phylogénétique
phylogenèse
caractère dérivé
autapomorphie
synapomorphie
innovation évolutive
groupe monophylétique
clade
groupe paraphylétique
cours / présentation, démonstration
15/03/2007
Classer musiques, langues, images, textes et génomes
Auteur(s)
:
Delahaye Jean-Paul
Description
:
Les algorithmes de compression de données permettent de classer automatiquement toutes sortes de fichiers. Ce « classement » est d’autant plus pertinent que ces algorithmes sont performants.
distance de similarité
algorithme de compression
complexité de Kolmogorov
arbre phylogénétique
calcul réversible
fuscia
cours / présentation, démonstration
10/05/2010
Évolution et phylogénie
Auteur(s)
:
Gautier Christian
Description
:
Comprendre l’évolution des organismes vivants reste un enjeu majeur de la biologie. L’étude de la transmission de l’information génétique bénéficie des apports de la théorie de l’information.
évolution des organismes vivants
information génétique
mutation
interdisciplinarité
arbre phylogénétique
transfert horizontal
biologie systémique
fuscia
cours / présentation, démonstration
21/07/2010
Faire l’inventaire du vivant : informatique et systématique
Auteur(s)
:
Ferrieux Catherine
Description
:
2010 est l’année internationale de la biodiversité, c’est l’occasion de faire le point sur ce thème et ses liens avec l’informatique.
biologie systémique
systématique phylogénétique
identification taxonomique
taxon
base de données scientifiques
clique
fuscia
cours / présentation
2004
L'arbre du vivant
Auteur(s)
:
Mirouze Jean-Pierre
Description
:
La biodiversité de notre planète est gravement menacée. Les scientifiques du Muséum National d'Histoire Naturelle de Paris présentent les collections de la zoothèque et de l'herbier, riches de millions de spécimens, véritable patrimoine de l'humanité. Parallèlement les bio-informaticiens mettent ...
biodiversité
espèces
systématique
ADN
arbre phylogénétique
cours / présentation
10/11/2012
Mesures de la biodiversité
Auteur(s)
:
Marcon Eric
Description
:
Comprendre les différentes mesures de la biodiversité, la façon dont elles sont construites, leur intérêt et les façons de les utiliser.
biodiversité
mesures
diversité
phylogénétique
OEF La méthode de classification phylogénétique
Auteur(s)
:
Faivre Jonathan
Description
:
collection d'exercices pour comprendre les méthodes de classification phylogénétique. Ce module est composé des exercices suivants : - A - Définitions en classification ; - B - Êtres vivants plus proches parents ; - C - Caractères partagés par des êtres vivants ; - D - Ancêtres ...
Biologie
Phylogénie
wims
Évolution
Arbre phylogénétique
cours / présentation
02/10/2008
Quand la paléontologie revoit ses données
Auteur(s)
:
Langlois Cyril
Description
:
Analyses de grandes bases de données de fossiles à l'aide d'outils mathématiques, statistiques et informatiques récents. Deux articles de l'été 2008 conduisent à réviser des conclusions et des idées plus anciennes : ils rappellent ainsi combien les progrès des sciences historiques comme la paléo ...
paléontologie
fossile
base de données
paléoclimatologie
classification
biodiversité
paléo-biodiversité
taxon
clade
phylogénétique
Dinosauriens
super-arbre
paléogéographie
cours / présentation, démonstration
06/06/2006
Symbiologik : jouez avec les gènes
Auteur(s)
:
Deroche Nicolas, Giraud Mathieu
Description
:
Ce jeu vous propose d’expérimenter trois tâches parmi les plus courantes en bioinformatique : l’assemblage de fragments d’ADN, la recherche de motifs communs à plusieurs protéines, la construction d’arbres phylogénétiques.
jeu
ADN
recherche de motifs
arbre phylogénétique
séquençage du génome
fuscia
cours / présentation
5.4. L’algorithme UPGMA
Auteur(s)
:
RECHENMANN Francois, PARMENTELAT Thierry
Description
:
L'algorithme, que nous allons étudier pour la reconstruction d'arbres phylogénétiques à partir des distances, s'appelle UPGMA. Un nom plutôt compliqué pour une méthode qui est plutôt simple. Et même, on le verra trop simple. UPGMA signifie Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean. Nous ...
génomique
algorithmique
bioinformatique
biologie cellulaire et moléculaire
modélisation
arbre phylogénétique
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