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bioinformatique
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bioinformatique
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cours / présentation
23/11/2011
Algorithmes et génomes : analyse informatique de l'information génétique : 1ere partie
Auteur(s)
:
RECHENMANN Francois
Description
:
La séquence de caractères est un des objets que les informaticiens connaissent bien et pour lequel ils ont développé de très nombreux algorithmes. C’est donc très naturellement que l’informatique et les sciences du vivant se sont rencontrées autour de la problématique de l’analyse des séquences ...
algorithme
bioinformatique
analyse de génome
séquence génomique
cours / présentation
23/11/2011
Algorithmes et génomes : analyse informatique de l'information génétique : 2ème partie
Auteur(s)
:
RECHENMANN Francois
Description
:
La séquence de caractères est un des objets que les informaticiens connaissent bien et pour lequel ils ont développé de très nombreux algorithmes. C’est donc très naturellement que l’informatique et les sciences du vivant se sont rencontrées autour de la problématique de l’analyse des séquences ...
algorithme
bioinformatique
analyse de génome
séquence génomique
cours / présentation
24/03/2010
Algorithmes et programmes de comparaison de séquences : Interprétation des résultats : E-value, P-value. (Bioinformatique)
Auteur(s)
:
Jaspard Emmanuel
Description
:
Présentation de l’algorithme de Needleman & Wunsch et de l’algorithme de Smith & Waterman. L’auteur aborde également les programmes FASTA, BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) et le programme Clustal W. Pour terminer, il traite du modèle de Markov caché et de l’interprétation des ...
algorithme génétique
Needleman
Wunsch
Smith
Waterman
bio-informatique
logiciel
cours / présentation, démonstration
22/05/2015
Analyser les génomes des océans
Auteur(s)
:
Peterlongo Pierre
Description
:
Grâce aux techniques de séquençage de l’ADN, nous avons aujourd’hui les moyens technologiques de connaitre le génome des organismes vivants, le plancton des océans y compris. Mais est-ce si simple ? Comment extraire de l’information biologique de gigantesques masses de données contenant des fragments ...
séquençage ADN
bioinformatique
extraction information
génome
algorithme
cours / présentation
17/09/2006
La bioinformation : Molécules support, types et obtention. (Bioinformatique)
Auteur(s)
:
Jaspard Emmanuel
Description
:
L’auteur présente la notion de bioinformation. Il aborde les deux types de molécules support de la bioinformation : les acides nucléiques (ADN, ARN) et les protéines, les deux types de bioinformation : la séquence des nucléotides et la séquence des acides aminés et l'obtention des sé ...
bio-informatique
acide nucléique
ADN
ARN
protéine
nucléotide
molécule
cours / présentation
02/02/2009
La bioinformatique : Définition, description, démarche et principales étapes.
Auteur(s)
:
Jaspard Emmanuel
Description
:
L’auteur propose une introduction à la bioinformatique. Il décrit cette discipline, explique la démarche de celle-ci, fait un rappel historique sur les principales étapes en biologie moléculaire et en informatique. Il aborde aussi des domaines d’étude en « ome » ou « omique ». Des ré ...
bio-informatique
banque de données
biomolécule
molécule
cours / présentation
17/09/2008
Le stockage de la bioinformation : Les banques de données. (Bioinformatique)
Auteur(s)
:
Jaspard Emmanuel
Description
:
L'auteur de la ressource propose une liste de banque de données généralistes ou spécialisées dans l'information biologique. Des références bibliographiques complètent le cours.
bio-informatique
information biologique
banque de données
cours / présentation
29/01/2010
Les matrices de substitution. (Bioinformatique)
Auteur(s)
:
Jaspard Emmanuel
Description
:
L’auteur de la ressource présente les matrices nucléiques et protéiques : PAM ("Point Accepted Mutation"), BLOSUM ("BLOcks SUbstitution Matrix"), Gonnet. Il propose aussi quelques pistes pour choisir la matrice protéique, ainsi que des références bibliographiques.
acide nucléique
acide aminé
Henikoff
matrice
protéine
bio-informatique
cours / présentation, démonstration
20/12/2011
Les séquenceurs à haut débit
Auteur(s)
:
Giraud Mathieu, Salson Mikaël
Description
:
Depuis le milieu des années 2000, les séquenceurs à haut débit révolutionnent la biologie. Traiter les données de ces séquenceurs demande des compétences pluridisciplinaires.
bioinformatique
génome humain
séquençage ADN
données génomiques
méthodes algorithmiques
indexation ADN
fuscia
cours / présentation
12/11/2007
Quelques éléments à propos de la thérapie génique. (Bioinformatique)
Auteur(s)
:
Jaspard Emmanuel
Description
:
L’auteur propose un cours sur la thérapie génique. Après avoir défini le sujet, il aborde les erreurs de métabolisme des mitochondries dans les maladies génétiques. Il poursuit avec un exemple de produit de thérapie génique pour la myopathie de Duchenne. Enfin, un tableau récapitule les ...
thérapie génique
maladie héréditaire
mitochondrie
gène
chromosome
bio-informatique
bioinformatique
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