MOOC : Chimiométrie, chapitre 1/2: les méthodes non supervisées
- Génie chimique
Présentation du MOOC Chimiométrie, chapitre 1/2: les méthodes non supervisées
Informations pratiques sur le MOOC
Description du MOOC
- Peut-on estimer la composition chimique d'un échantillon en quelques secondes et sans le toucher ?
- Identifier l'origine de cet échantillon ?
Oui ! C'est possible, en réalisant l'acquisition d'un spectre de l'échantillon et son traitement avec des outils de chimiométrie.
Chemoocs est destiné à vous rendre autonome en chimiométrie. Mais le contenu est dense ! C'est pourquoi le MOOC a été divisé en 2 chapitres. Le présent chapitre, le premier, porte sur les méthodes non supervisées. Vous aurez quelques mois pour assimiler son contenu. Ensuite, le second chapitre, pour lequel il faudra vous réinscrire sur FUN-MOOC, portera sur les méthodes supervisées et la validation de méthodes analytiques.
Chemoocs est orienté vers les applications de spectrométrie proche infrarouge, les plus répandues. Toutefois, la chimiométrie est ouverte à d'autres domaines spectraux :
- moyen infrarouge
- ultraviolet
- visible
- fluorescence ou Raman
- bien d'autres applications non spectrales
Donc pourquoi pas dans votre domaine ?
Vous appliquerez vos connaissances en réalisant nos exercices d'application grâce au logiciel ChemFlow, gratuit et accessible via un simple navigateur internet depuis un ordinateur ou un smartphone. ChemFlow a été conçu pour être aussi convivial et intuitif que possible. Ainsi, il ne nécessite aucune connaissance en programmation.
À la fin du MOOC, vous aurez acquis le savoir-faire nécessaire pour traiter vos propres données.
Bienvenue dans le monde fascinant de la chimiométrie.
Déroulement
La durée totale de ce chapitre est de 7 semaines, une semaine d'introduction suivie de 6 semaines de cours.
Vous découvrirez 2 méthodes de chimiométrie par semaine.
Le MOOC est proposé sous la forme de vidéos, repris dans un fichier pdf détaillé.
Pour chacune des méthodes présentées vous pourrez :
- tester vos connaissances avec un quiz
- mettre en application vos connaissances avec un exercice en utilisant ChemFlow ou votre propre outil de chimiométrie
Plan du MOOC
- Semaine 0 :
- Présentation du MOOC
- Prise en main de la plateforme FUN
- Découverte du logiciel ChemFlow
- Introduction à la chimiométrie avec quelques définitions
- Semaine 1 :
- Statistiques simples
- ACP (1/2)
- Semaine 2 :
- ACP (2/2)
- Prétraitements (1/2)
- Semaine 3 :
- Classification non supervisée
- Prétraitements (2/2)
- Semaine 4 :
- Décomposition spectrale (démélange)
- Analyse en composantes indépendantes
- Données N-way : méthode Parafac
- Semaine 5 :
- Données multinlocs
- Méthode multibloc Acom
- Semaine 6 :
- Méthode multiblocs ACCPS
- Méthode multiblocs Statis
Évaluation
Une attestation de suivi avec succès vous sera délivrée si vous obtenez une note supérieure à 50 sur 100.
L'évaluation se fera :
- par des quiz à l'issue de chaque grain (30% de la note finale)
- par un exercice de mise en application de plusieurs méthodes évoquées dans le MOOC (70% de la note finale)
- Certificat proposé : non
- Attestation proposée : oui (gratuit)
Informations pédagogiques
Public
- Public visé :
Ce MOOC s'adresse aux personnes pour lesquelles les mots :
- "spectroscopie"
- "chimiométrie"
- "analyse de données multivariées"
sont déjà connus et suscitent un intérêt.
Il s'adresse aux :
- étudiants, pour une remise à niveau avant leur entrée en master ou en thèse impliquant la chimiométrie
- étudiants en mathématiques intéressés par des applications pratiques à l'algèbre matricielle
- stagiaires, niveau master/ingénieur ou étudiants en thèse, ayant besoin d'utiliser ponctuellement des outils de chimiométrie
- techniciens utilisateurs de spectromètres souhaitant mieux comprendre les traitements de leurs données
- ingénieurs ou chercheurs développant des méthodes rapides d'analyse, au laboratoire comme sur le terrain
- Attendus du MOOC :
Ce MOOC nécessite d'avoir le niveau Bac+2 en sciences ou déjà une expérience pratique en spectroscopie ou chimiométrie. Il faut aussi être francophone : le mooc est en Français, toutefois le logiciel ChemFlow est accessible en Français et en Anglais
Objectif pédagogique
Le but du MOOC est d'acquérir le savoir-faire nécessaire pour traiter les données spectrales d'un échantillon afin d'en déterminer la composition chimique et identifier son origine.
Édition et diffusion du MOOC
Édition
Diffusion
Plateforme
- Accédez à la plateforme : FUN-MOOC
- Vous inscrire au MOOC : Chimiométrie, chapitre 1/2: les méthodes non supervisées
Conditions d'utilisation
- Du cours : Licence Creative Commons BY-SA
- Du contenu produit par les participants : Licence Creative Commons BY-NC-SA
Équipe pédagogique
Dominique Bertrand
Ancien directeur de recherche à l'INRA à la retraite
Julien Boccard
Laboratoire des Sciences Analytiques de l'Université de Genève
Jean-Claude Boulet
INRA de Montpellier - U.M.R.1083 Sciences Pour l'Œnologie
Philippe Courcoux
Marjolaine Deschamps
INRA de Versailles-Grignon, U.M.R.1402 ECOSYS, pôle Science du Sol
Ludovic Duponchel
Université de Lille - Laboratoire de Spectrochimie Infrarouge et Raman, U.M.R. C.N.R.S. 8516
Martin Ecarnot
INRA de Montpellier, U.M.R.1334 AGAP, équipe Ge²Pop
Amandine Etayo
INRA Laboratoire d'Analyses des Sols d'Arras
Max Feinberg
Ancien directeur de recherche à l'INRA à la retraite
Fabien Gogé
IRSTEA de Montpellier U.M.R. ITAP
Mohamed Hanafi
Benoît Jaillais
INRA de Nantes Unité Sensométrie Chimiométrie
Anne Jaulin
INRA de Versailles, U.M.R.1402 Ecosys, pôle Écotoxicologue
Éric Latrille
INRA Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement à Narbonne
Christophe Lebègue
SupAgro INRA à Montpellier
Sébastien Preys
Christelle Reynes
Université de Montpellier - Institut de Génomique Fonctionnelle
Jean-Michel Roger
IRSTEA de Montpellier U.M.R. ITAP
Virginie Rossard
INRA Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement à Narbonne
Serge Rudaz
Analyse Biomédicale et Métabolomique (A.B.M.) Université de Genève