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MOOC Recherche reproductible : principes méthodologiques pour une science transparente

Inscriptions ouvertes jusqu'au 10 décembre 2018

Vous souhaitez améliorer votre prise de notes, votre gestion des données et des calculs ? Vous voulez préparer des documents réplicables et partager en toute transparence les résultats de vos travaux ? Ce MOOC est fait pour vous !

MOOC sur FUN-MOOC - du 22.10.18 au 19.12.2018
Auteur(s): Christophe Pouzat, Arnaud Legrand, Konrad Hinsen

Présentation du MOOC Recherche reproductible : principes méthodologiques pour une science transparente

Informations pratiques sur le MOOC

  • Type: MOOC, cours en ligne, quiz, exercices, devoir, attestation de suivi
  • Temps d'apprentissage: 8 semaines
  • Niveau: à partir du niveau Master
  • Durée d'exécution: de 04:00h à 08:00h/semaine
  • Langues: français, sous-titrage anglais
  • Contenu: vidéos
  • Public cible: doctorants, chercheurs, étudiants en master, enseignants, ingénieurs
  • Age attendu: 21 et +
  • Droits: Licence Creative Commons BY-NC

Description du MOOC

  • Vous prenez des notes et vous voulez vous y retrouver ?
  • Vous faites des calculs sur ordinateur et vos résultats changent d'un jour à l'autre ?
  • Vous aimeriez partager avec vos collègues vos analyses de données et vos développements méthodologiques et qu'ils puissent les réutiliser ?

Ce MOOC est pour vous, doctorant, chercheur, étudiant en master, enseignant, ingénieur de toutes disciplines qui souhaitez vous former à des environnements de publication et des outils fiables :

  • Markdown pour la prise de note structurée
  • des Outils d'indexation
  • Gitlab pour le suivi de version et le travail collaboratif
  • Notebooks pour combiner efficacement calcul, représentation et analyse des données :
    • Jupyter
    • Rstudio
    • org-mode

Vous apprendrez au cours des exercices à utiliser ces outils pour améliorer :

  • votre prise de notes
  • votre gestion des données
  • votre gestion des calculs

Nous vous présenterons aussi les enjeux et les difficultés de la recherche reproductible.

Déroulement du MOOC

Ce MOOC est composé de 4 modules qui combinent :

  • des vidéos
  • des quiz
  • des exercices pour la mise en pratique des méthodes présentées

Nous proposons 3 parcours différents dont chacun utilise une technologie de notebook :

  • Le premier parcours repose sur Jupyter et le langage Python. Il ne nécessite aucune installation de votre part sur votre ordinateur.
  • Le deuxième parcours repose sur RStudio et le langage R. Il nécessitera l'installation de RStudio sur votre ordinateur mais nous vous guiderons dans ce processus en temps voulu.
  • Le troisième parcours repose sur Emacs/Org-Mode et les langages Python et R. Il nécessitera l'installation d'Emacs, Python, et R sur votre ordinateur mais nous vous guiderons dans ce processus en temps voulu.

Ce MOOC est en majorité bilingue français / anglais. Les vidéos sont en français sous-titrées en français et en anglais. Les supports de cours au format pdf sont fournis en anglais et en français ainsi que les quiz et exercices.

Vous pouvez modifier votre profil pour avoir l'interface de FUN en anglais.

Plan du MOOC

  • Module 1 : Cahier de notes, cahier de laboratoire
  • Module 2 : La vitrine et l'envers du décor : le document computationnel
  • Module 3 : La main à la pâte : une analyse réplicable
  • Module 4 : Vers une étude reproductible : la réalité du terrain

Évaluation

À l'issue du MOOC, une attestation de suivi avec succès vous sera délivrée si vous obtenez la note minimale requise. L'évaluation est basée sur des quiz, des exercices pratiques et un devoir qui sera évalué par d'autres élèves.

Informations pédagogiques

Public

  • Public visé : Ce MOOC est destiné aux :
    • doctorants
    • chercheurs
    • étudiants en master
    • enseignants
    • ingénieurs
  • Pré-requis : Le premier module ne requiert aucune connaissance particulière. Dès le deuxième module, une connaissance des bases du langage Python ou du langage R est nécessaire. Dans le quatrième module, nous traitons des sujets plus spécialisés dont chacun peut nécessiter des compétences particulières.

Objectif pédagogique du MOOC

  • Objectif : À l'issue de ce MOOC, vous aurez acquis les techniques vous permettant de préparer des documents réplicables et de partager en toute transparence les résultats de vos travaux.

Édition et diffusion du MOOC Recherche reproductible : principes méthodologiques pour une science transparente

Édition

Diffusion

Plateforme

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Conditions d'utilisation :

  • Du cours : Licence Creative Commons BY-NC. L'utilisateur doit mentionner le nom de l'auteur, il peut exploiter l'œuvre sauf dans un contexte commercial.
  • Des contenus produits par les participants : Licence Creative Commons BY-NC. L'utilisateur doit mentionner le nom de l'auteur, il peut exploiter l'œuvre sauf dans un contexte commercial.
Publication : 30.11.2018