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MOOC Voyage au cœur du vivant avec les rayons X : la cristallographie

Inscriptions ouvertes jusqu'au 11 novembre 2018

L'approche majeure pour résoudre la structure tridimensionnelle de macromolécules biologiques est la cristallographie aux rayons X. Ce MOOC est une initiation complète à la cristallographie biologique : depuis l'histoire de la méthode jusqu'à ses outils concrets.

MOOC sur FUN-MOOC - du 1.10.18 au 30.11.2018
Auteur(s): Marie-Hélène Le Du, Pierre Legrand, Yves Mechulam, Sylvain Ravy, Serena Sirigu

Présentation du MOOC Voyage au cœur du vivant avec les rayons X : la cristallographie

Informations pratiques sur le MOOC

  • Type: MOOC, cours en ligne, quiz, attestation de suivi
  • Temps d'apprentissage: 6 semaines
  • Niveau: à partir du Master
  • Durée d'exécution: 03:00h/semaine
  • Langues: français
  • Contenu: vidéos
  • Public cible: étudiants, ingénieurs, chercheurs en biologie
  • Age attendu: 21 et +
  • Droits: Licence Creative Commons BY-NC-ND

Description du MOOC

L'utilisation des structures tridimensionnelles de macromolécules biologiques fait partie du quotidien d'un grand nombre de biologistes. Ces structures permettent :

  • de comprendre leur fonctionnement
  • de dessiner des mutants pour étudier leur fonction
  • de dessiner des molécules pour les bloquer ou les activer

Pour résoudre ces structures de macromolécules biologiques, on utilise la cristallographie par rayon X. Ce MOOC va vous initier à la cristallographie biologique, depuis l'histoire de la méthode jusqu'à ses outils concrets. Les connaissances et l'expérience des experts du domaine vous seront transmises par le biais de vidéos théoriques et en situation.

Déroulement du MOOC

Le MOOC duree 5 semaines. Pour cette nouvelle session, vous pourrez appliquer vos nouvelles connaissances au cours d'une semaine supplémentaire.

Plan du MOOC

1.       Structures tridimensionnelles des macromolécules biologiques

  • Des structures tridimensionnelles : pourquoi faire ?
  • Des structures tridimensionnelles : comment faire ?

2.       Les fondamentaux de la cristallographie

  • Histoire de la cristallographie aux rayons X
  • Pourquoi et comment produire des rayons X ?

3.       L'échantillon : de sa production à sa cristallisation

  • Préparer son échantillon biologique
  • Cristalliser une macromolécule biologique

4.       Une semaine sur une ligne de lumière du synchrotron "SOLEIL"

  • L'acquisition des données de diffraction
  • Le traitement des données de diffraction

5.       Structures tridimensionnelles des macromolécules biologiques

  • Le problème des phases
  • La résolution de la structure cristallographique
  • La construction, l'interprétation et l'analyse du modèle

6.       À vous de jouer : dans la peau d'un cristallographe (nouveauté session 2)

  • Traitez un jeu de données de diffraction
  • Résolvez une structure
  • Construisez un modèle 3D

Évaluation

2 types d'évaluations vous seront proposés :

  • un quiz à la fin de chaque chapitre
  • une évaluation par les pairs lors de la dernière semaine

Une attestation de suivi avec succès vous sera délivrée si vouis avez obtenu au moins 60% de bonnes réponses aux quiz et à l'évaluation finale.

Un niveau 2 pourra vous être délivré si vous réussissez au moins une activité de la semaine 6.

Informations pédagogiques

Public

  • Public visé : Ce MOOC est conçu pour :
    • des étudiants en biologie
    • des étudiants en thèse
    • des stagiaires post-doctorants
    • des ingénieurs ou chercheurs en biologie
  • Pré-requis : Ce MOOC nécessite le niveau Master

Objectif pédagogique du MOOC

  • Objectif : À la fin de ce MOOC vous serez capable :
    • d'exploiter les structures tridimensionnelles avec un bon sens critique
    • de résoudre la structure tridimensionnelle d'une macromolécule par cristallographie.

Édition et diffusion du MOOC Voyage au cœur du vivant avec les rayons X : la cristallographie

Édition

Diffusion

Plateforme

Conditions d'utilisation :

  • Du cours : Licence Creative Commons BY-NC-ND (Attribution - Pas d'Utilisation Commerciale - Pas de Modification).
  • Des contenus produits par les participants : Licence Creative Commons BY-NC-ND (Attribution - Pas d'Utilisation Commerciale - Pas de Modification).
Publication : 20.08.2018

Partenaires et contributeurs

Partenaires

Ce MOOC "Voyage au cœur du vivant avec des rayons X : la cristallographie" est le fruit d'une étroite collaboration entre plusieurs établissements au sein de l'Université Paris-Saclay, porté par le C.E.A. de Saclay en collaboration avec le Synchrotron SOLEIL et l'École polytechnique.

Remerciements